Kindaichi, Miyuki und Inspektor Kenmochi sind zu einer Jubiläumsveranstaltung eingeladen und besuchen daher erneut das Opernhaus. Sie entdecken, dass dort das »Phantom der Oper« abermals aufgeführt wird. Es dauert allerdings nicht lang bis die ersten Mitglieder der Schauspieltruppe dem äußerst realen Phantom zum Opfer fallen. Wieder muss Kindaichi eine Mordserie im Opernhaus aufklären.